Cuộc Chiến Chén Thánh lần thứ năm ở thành phố Fuyuki đã đi đến một bước ngoặt, trong đó tính mạng của tất cả những người tham gia bị đe dọa khi kẻ thù giấu mặt cuối cùng cũng lộ diện. Khi Shirou Emiya, Rin Toosaka và Illyasviel von Einzbern phát hiện ra bản chất thực sự, đồi bại của bóng đen đang hoành hành khắp thành phố, họ nhận ra tình hình thảm khốc đến mức nào.